农村黑臭水体的形成是由于多种因素导致的，包括农村生活污水、畜禽养殖污水、工业企业废水中的污染物，以及农业种植的面源污染、岸边垃圾堆放等产生的污染物进入农村水体后，导致水体中溶氧量降低形成黑臭。水体中氮、磷物质含量过高，也会引起水体发黑发臭。